NGS（次世代シーケンサー）を用いた菌叢解析のノウハウ-腸内細菌叢を例に-【Zoom開催セミナー】

セミナー趣旨

昨今注目される腸内フローラの研究を支える基盤技術の一つである、次世代シーケンサーNGSによる菌叢解析技術について、原理から実践まで紹介する。数百種を含むヒト腸内細菌叢のスナップショットデータが、次世代シーケンサーでごく普通に得られるようになってきた。しかし、そのデータを正しく処理し、正しく解釈することは未だに一筋縄ではいかないのが現状である。そこで、本講習会ではそのノウハウを実践的レベルで講習する。特に、NGSのデータ処理のポイントと注意点、複数存在する解析プラットフォーム選択のポイント、何が有意で何が有意でないかどのように判断していくのか、菌叢データから情報マイニングがどのようにできるか、等について解説する。

習得できる知識

• NGSデータの処理法の原理とポイント
• 各NGSデータ解析プラットフォーム(Usearch, QIIME, EZBiocloud等)の特徴の理解
• NGSデータの統計解析の原理とポイント
• NGSデータからのデータマイニング実例

セミナープログラム

1. イントロダクション
   • 腸内細菌の基礎、最近の研究動向（国内外含む）
     ⇒近年、食品・医薬品業界にさらに活用、展開が進む腸内細菌研究についての紹介
   • NGSとは、NGSの基本構成
     ⇒NGSの登場によって何ができるようになったのか、歴史的背景も含めた基本的な話
2. NGSによる腸内細菌叢解析の実践
   ⇒いざ解析！サンプル準備から論文作成まで。失敗例から成功例まで事例紹介と解説。陥りがちな、やりがちなミスやトラブル対応も含めて。
   1. サンプル準備
   2. NGSによる菌叢解析
   3. データ処理
   4. 統計解析
   5. データマイニング・相関解析
   6. 論文作成
3. NGSの活用例
   ⇒疫学調査から医薬品・食品開発への利用まで
   
4. 菌叢解析のこれから、将来展望
   ⇒メタボローム解析、カルチャロミクスとの併用の重要性
   ⇒解析プラットフォームとデータベースの整備への期待
   

等

キーワード：NGS, 腸内細菌叢, 腸内フローラ, 16S rRNA, MiSeq, マイクロバイオーム

参考文献：
１．今すぐ始めるメタゲノム解析実験プロトコール（羊土社）
２．QIIMEホームページ：http://qiime.org/
３．Usearchホームページ：https://www.drive5.com/usearch/
４．EZ BioCloudホームページ：https://www.ezbiocloud.net/

セミナー講師

九州大学大学院農学研究院 生命機能科学部門・システム生物工学講座
教授 中山 二郎 先生

■経歴
1989年3月 東京大学大学院農学系研究科農芸化学専攻修士課程修了
1989年4月 東京大学農学部助手
1994年5月 博士（農学）（東京大学）の学位取得
1998年4月～1999年9月 オランダ王国ワーゲニンゲン大学微生物学研究室訪問研究員
2001年10月 九州大学大学院農学研究院助教授
2007年4月 九州大学大学院農学研究院准教授
2020年3月 九州大学大学院農学研究院教授
■専門および得意な分野・研究
専門：微生物学・生物有機化学
研究：(1)腸内フローラの構造と機能、(2)細菌のクオラムセンシング(菌密度依存的遺伝子発現制御機構）の解明と利用、(3)乳酸菌の生産する抗菌ペプチド「バクテリオシン」の構造と機能
■本テーマ関連学協会での活動
加盟学会：日本農芸化学会（産学官学術交流委員、西日本支部参与）、日本生物工学会（九州支部参与）、腸内細菌学会、日本乳酸菌学会

セミナー受講料

1名41,800円(税込（消費税10％）、資料付)
　＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円
　＊学校法人割引；学生、教員のご参加は受講料50％割引。

受講について

※本講座は、お手許のPCやタブレット等で受講できるオンラインセミナーです。

配布資料・講師への質問等について

• 配布資料は、印刷物を郵送で送付致します。
  お申込の際はお受け取り可能な住所をご記入ください。
  お申込みは4営業日前までを推奨します。
  それ以降でもお申込みはお受けしておりますが（開催1営業日前の12:00まで）、
  テキスト到着がセミナー後になる可能性がございます。
• 当日、可能な範囲で質疑応答も対応致します。
  （全ての質問にお答えできない可能性もございますので、予めご容赦ください。）
• 本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、
  無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売等を禁止致します。

下記ご確認の上、お申込み下さい

• PCもしくはタブレット・スマートフォンとネットワーク環境をご準備下さい。
• ご受講にあたり、環境の確認をお願いしております（20Mbbs以上の回線をご用意下さい）。
  各ご利用ツール別の動作確認の上、お申し込み下さい。
• 開催が近くなりましたら、当日の流れ及び視聴用のURL等をメールにてご連絡致します。

Zoomを使用したオンラインセミナーとなります

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