《デモンストレーション・解析事例から実践的に学べる》バイオインフォマティクスの基礎と不完全データに対するリスク管理ノウハウ

セミナー趣旨

習得できる知識

・バイオインフォマティクスの基礎から産業利用の最新動向
・実験計画・品質管理における適切なサンプリング設計
・不完全なデータを見極めるための解析手順
・公共データベースを活用したデータ解析におけるリスク管理
・シークエンスデータを用いたコンタミネーションの同定・追跡調査等の実務応用

セミナープログラム

1. バイオインフォマティクスの基礎と産業利用の現状
　1-1. バイオインフォマティクスの基礎
　　1-1-1. 次世代シークエンサー
　　1-1-2. 公共データベース
 
　1-2. ゲノム解析の基礎
　　1-2-1. ゲノムデータとは
　　1-2-2. ゲノムアセンブリとマッピングの原理
 
　1-3. トランスクリプトーム解析の基礎
　　1-3-1. トランスクリプトームデータとは
　　1-3-2. 定量の原理
　　1-3-3. トランスクリプトーム解析事例
 
2. 不完全データを防ぐための実験計画と品質管理
　2-1. 実験計画
　　2-1-1. 時系列解析における適切なサンプリングタイミングの設計
　　2-1-2. 目的に応じたサンプル数と生物学的反復
 
　2-2. 核酸の品質確認
　　2-2-1. 分光光度計等を用いた濃度・純度測定
　　2-2-2. 微量電気泳動装置等を用いた核酸完全性（RIN値）の評価
 
　2-3. シークエンスプラットフォームの選択
　　2-3-1. ショートリードシークエンサー
　　2-3-2. ロングリードシークエンサー 
 
3. 不完全データを見破るためのデータ解析
　3-1. コマンドライン操作の基礎
　　3-1-1. ターミナル
　　3-1-2. ファイルとディレクトリ
 
　3-2. RNA-seqデータ解析に用いるツールとワークフロー
　　3-2-1. クオリティコントロールからマッピングまでの手順
　　3-2-2. 発現量の定量からカウントテーブル作成までの手順
　　3-2-3. データの全体像の俯瞰（PCA・クラスタリングなど）
　　3-2-4. 発現変動遺伝子解析
 
　3-3. データ解析デモンストレーション
　　3-3-1. 分解したRNAに由来するシークエンスデータの解析
　　3-3-2. 汚染されたシークエンスデータの解析
　　3-3-3. 生物種の取り違えに由来するシークエンスデータの解析
 
4. シークエンスデータの産業利用とリスク管理
　4-1. バイオ産業・製品開発におけるシークエンスデータ活用事例
　4-2. 公共データベースのデータ品質のばらつきとアノテーションエラー
　4-3. 製造プロセスにおけるコンタミネーションの同定・追跡調査
　4-4. サンプリング操作時のタイムラグがもたらす人工的な遺伝子発現変動
  
5. まとめ・質疑応答

セミナー講師

セミナー受講料

49,500円

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主催者

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備考

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アーカイブ配信受講：PDFテキスト(印刷可・編集不可)
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