基本的な考え方から学ぶ！初学者のためのプロテオミクス活用入門【実例解説付き】～分析計画の立て方、試料調製、質量分析、および分析データの解析と視覚化～

セミナー趣旨

　プロテオミクス (Proteomics) は、発現タンパク質群の動態（プロテオームProteome）を包括的に分析することによって生命現象の全体像をつかむ学問です。分析技術の発展とともに、現在のプロテオミクスは基礎研究ばかりでなく医療の分野にもインパクトを与え続けています。

　本セミナーでは、プロテオミクスのことを一通り理解したい方々を対象に、質量測定を基盤としたプロテオーム分析実験の原理やノウハウを解説します。データ解析の実例も織り交ぜながら、分析の一連の流れを把握していただけるような構成にしました。

■講演中のキーワード
　・Label-free proteomics, LFQ
　・MAプロット
　・ボルケーノプロット Volcano plot
　・False discovery rate, FDR
　・jPOST

習得できる知識

 ・プロテオミクスに用いられる質量分析
 ・タンパク質同定計量情報の構造
 ・タンパク質の翻訳後修飾の分析
 ・プロテオームデータの解析と視覚化の要領
 ・医学や生物学におけるプロテオミクスの活用
 ・分析計画の立て方
 ・論文投稿の注意点

セミナープログラム

0. プロテオミクスを始めよう（序論として）
　0.1. 「プロテオーム」「プロテオミクス」とは？
　0.2. プロテオミクスでわかること、わからないこと
　0.3. プロテオミクスの歴史
　0.4. 分析の様子（写真と動画）

1. 質量分析を基盤としたプロテオミクス
　1.1. 質量分析の威力
　1.2. ペプチド断片を測る
　1.3. 液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析を連結した測定系 (LC-MS/MS)
　1.4. 試料調製における注意点
　1.5. 標識法と非標識法
　1.6. 翻訳後修飾の分析： リン酸化とNグリコシル化を中心に

2. プロテオミクスで使われている質量分析計
　2.1. 質量分析部のいろいろ： イオントラップ、三連四重極、qTOF、他
　2.2. 測定データの取得方法： DDA、DIA、選択イオンモニタリング
　2.3. 測定データ取得の高速化と高深度化： プロテオームの「ビッグデータ」

3. プロテオームデータの処理と解析
　3.1. 一般的な処理手順： 同定情報と計量情報の統合
　3.2. ペプチド/タンパク質の同定
　　・アミノ酸配列データベース検索の原理
　　・偽陽性ヒットの検証： Target-Decoy検索とFalse discovery rate (FDR)
　　・複数のタンパク質におけるペプチド同定情報の共有
　3.3. タンパク質組成の試料間計量比較
　　・計量値の正規化
　　・比較計量値の散布図：MAプロットとボルケーノプロット

4. おもな情報解析の手法
　4.1. 膜結合タンパク質の予測
　4.2. Gene ontology (GO) の活用： 尤度解析
　4.3. クラスター解析（階層クラスタリング）
　4.4. 主成分分析
　4.5. ウェブ上の情報解析ツール

5. 分析実験と情報解析の実例（リン酸化プロテオミクス）

6. プロテオームの分析計画から論文投稿まで
　6.1. 計画策定に当たっての注意点
　6.2. 選択肢としての分析の外注
　6.3. 公共リポジトリへのプロテオームデータの登録

7. 質疑応答＆個別ご質問・ご相談

上記のプログラム項目と内容は一部変更する場合があります。
あらかじめご了承いただけると幸いです。

※途中、小休憩を挟みます。

セミナー講師

株式会社メディカル・プロテオスコープ　取締役、生体分子解析部部長（兼任）
博士（薬学）　川上隆雄 先生

■経歴
　埼玉県川越市出身。さいたま市在住。東京理科大学大学院薬学研究科博士後期課程を修了（1997年）。
　その後、日本グラクソ株式会社（現グラクソ・スミスクライン株式会社） 研究本部、
　東京医科大学臨床プロテオーム研究寄附講座などを経て現職。

■専門および得意な分野・研究
　・プロテオミクスにおける技術開発全般
　・タンパク質化学

■本テーマ関連学協会での活動
　・日本プロテオーム学会研究開発功績賞（共同受賞）（平成25年9月）
　・日本プロテオーム学会理事（平成27年1月～平成29年12月、令和3年1月～現在）
　・日本プロテオーム学会編集委員会委員（令和3年1月～現在）

セミナー受講料

1名41,800円(税込（消費税10％）、資料付)
　＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円
　＊学校法人割引；学生、教員のご参加は受講料50％割引。

受講について

 ・録音・撮影行為は固くお断り致します。
 ・講義中の携帯電話の使用はご遠慮下さい。
 ・講義中のパソコン使用は、講義の支障や他の方の迷惑となる場合がありますので、極力お控え下さい。
 　場合により、使用をお断りすることがございますので、予めご了承下さい。
 　＊ＰＣ実習講座を除きます。