プロテオミクス入門'23（初学者向け）分析計画、試料調製、質量分析、およびデータ解析の要所を徹底解説！＜東京・会場開催セミナー＞

セミナー趣旨

  プロテオミクス (Proteomics) は、発現タンパク質群の動態（プロテオームProteome）を包括的に分析することによって生命現象の全体像をつかむ学問です。分析技術の発展とともに、現在のプロテオミクスは基礎研究ばかりでなく医療の分野にもインパクトを与え続けています。
  本セミナーでは、プロテオミクスのことを一通り理解したい方々を対象に、質量測定を基盤としたプロテオーム分析実験の原理やノウハウを解説します。データ解析の実例も織り交ぜながら、分析の一連の流れを把握していただけるような構成にしました。

習得できる知識

本講座を受講すると、次に挙げる事項の理解が容易になります。
・プロテオミクスに用いられる質量分析
・タンパク質同定計量情報の構造
・タンパク質の翻訳後修飾の分析
・プロテオームデータの解析と視覚化の要領
・医学や生物学におけるプロテオミクスの活用
・分析計画の立て方
・論文投稿の注意点

セミナープログラム

0. プロテオミクスを始めよう（序論として）
　0.1. 「プロテオーム」「プロテオミクス」とは？
　0.2. プロテオミクスでわかること、わからないこと
　0.3. プロテオミクスの歴史
　0.4. 分析の様子（写真と動画）
1. 質量分析を基盤としたプロテオミクス
　1.1. 質量分析の威力
　1.2. ペプチド断片を測る
　1.3. 液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析を連結した測定系 (LC-MS/MS)
　1.4. 試料調製における注意点
　1.5. 標識法と非標識法
　1.6. 翻訳後修飾の分析：リン酸化とNグリコシル化を中心に
2. プロテオミクスで使われている質量分析計
　2.1. 質量分析部のいろいろ：イオントラップ、三連四重極、qTOF、他
　2.2. 測定データの取得方法：DDA、DIA、選択イオンモニタリング
　2.3. 測定データ取得の高速化と高深度化：プロテオームの「ビッグデータ」
3. プロテオームデータの処理と解析
　3.1. 一般的な処理手順：同定情報と計量情報の統合
　3.2. ペプチド/タンパク質の同定
　　・アミノ酸配列データベース検索の原理
　　・偽陽性ヒットの検証：Target-Decoy検索とFalse discovery rate (FDR)
　　・複数のタンパク質におけるペプチド同定情報の共有
　3.3. タンパク質組成の試料間計量比較
　　・計量値の正規化
　　・比較計量値の散布図：MAプロットとボルケーノプロット
4. おもな情報解析の手法
　4.1. 膜結合タンパク質の予測
　4.2. Gene ontology (GO) の活用：尤度解析
　4.3. クラスター解析（階層クラスタリング）
　4.4. 主成分分析
　4.5. ウェブ上の情報解析ツール
5. 分析実験と情報解析の実例
6. プロテオームの分析計画から論文投稿まで
　6.1. 計画策定に当たっての注意点
　6.2. 選択肢としての分析の外注
　6.3. 公共リポジトリへのプロテオームデータの登録
7. Q&A

※上記のプログラム項目と内容は一部変更する場合があります。あらかじめご了承いただけると幸いです。

■講演中のキーワード
・Label-free proteomics, LFQ
・MAプロット
・ボルケーノプロット Volcano plot
・False discovery rate, FDR
・jPOST

セミナー講師

 川上 隆雄 先生   株式会社メディカル・プロテオスコープ 取締役、生体分子解析部部長(兼任) 博士(薬学)

セミナー受講料

1名41,800円(税込（消費税10％）、資料付)
＊1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円
＊学校法人割引；学生、教員のご参加は受講料50％割引。

受講について

• 感染拡大防止対策にご協力下さい。
• セミナー会場での現金支払いを休止しております。
• 新型コロナウイルスの感染防止の一環として当面の間、昼食の提供サービスは中止させて頂きます。
• 配布資料は、当日セミナー会場でのお渡しとなります。
• 希望者は講師との名刺交換が可能です。
• 録音・録画行為は固くお断り致します。
• 講義中の携帯電話の使用はご遠慮下さい。
• 講義中のパソコン使用は、講義の支障や他の方の迷惑となる場合がありますので、極力お控え下さい。
  場合により、使用をお断りすることがございますので、予めご了承下さい。(＊PC実習講座を除きます。)