【中止】ケモインフォマティクスにおける化合物表現とプログラミング≪演習講座≫

化合物の表記方法、分子フィンガープリント、分子記述子、化合物検索など、物質構造の表現・数値化のポイントが分かる

Python、RDKitの演習で、プログラミングでの具体的留意点を学ぶ

セミナー趣旨

  近年、様々な分野でDX(デジタルトランスフォーメーション)が進んでおり、データ駆動型の研究開発手法に大きな期待が寄せられています。特に、有機化合物を扱う創薬研究や材料開発においては、ケモインフォマティクスの重要性が注目されています。ケモインフォマティクスとは、化合物情報の作成、管理、検索、分析、可視化など、コンピュータ・情報科学を用いて化学分野における様々な問題を取り扱う学問領域になります。
  本講演では、ケモインフォマティクスの基礎である、化合物の表記方法、分子フィンガープリント、分子記述子、化合物検索、化合物データベース構築について、プログラミング言語Pythonと、Pythonのケモインフォマティクス用ライブラリーであるRDKitを用いて、実践的内容を解説致します。Pythonの基本文法について事前に学びたい方は、Udemyの無料コース「Pythonプログラミングで知っておくべき15のこと」(https://bit.ly/python-15-things-to-know)をご受講下さい。

セミナープログラム

1.化合物の表記方法
 (1) MOL形式、SDF形式
 (2) SMILES記法
 (3) SMARTS記法
 (4) InChI、InChIKey
2.分子フィンガープリント・分子記述子の生成
 (1) RDKitでの分子フィンガープリントの生成
 (2) RDKitでの分子記述子計算
 (3) Mordredでの分子記述子計算
3.Pandasデータフレームを用いた化合物検索
 (1) 完全一致構造検索
 (2) 部分構造検索
 (3) 類似構造検索
4.SQLite3を用いた化合物DB構築
 (1) リレーショナルデータベースについて
 (2) SQLの基本
 (3) 化合物データベースの構築
5.データセットの可視化・クラスタリング
 (1) 化合物データベースからのデータ取得
【質疑応答】

セミナー講師

 藤 秀義 先生   ケモインフォ(株)(元アステラス製薬(株))

セミナー受講料

1名につき 55,000円(消費税込、資料付)
〔1社2名以上同時申込の場合のみ1名につき49,500円〕

受講について

  • 本講座はZoomを利用したLive配信セミナーです。セミナー会場での受講はできません。
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  • セミナー資料はお申込み時にお知らせいただいた住所へお送りいたします。
    お申込みが直前の場合には、開催日までに資料の到着が間に合わないことがあります。ご了承ください。
  • 当日は講師への質問をすることができます。可能な範囲で個別質問にも対応いたします。
  • 本講座で使用される資料や配信動画は著作物であり、
    録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売等を禁止いたします。
  • 本講座はお申し込みいただいた方のみ受講いただけます。
    複数端末から同時に視聴することや複数人での視聴は禁止いたします。
  • Zoomのグループにパスワードを設定しています。
    部外者の参加を防ぐため、パスワードを外部に漏洩しないでください。
    万が一部外者が侵入した場合は管理者側で部外者の退出あるいはセミナーを終了いたします。

※セミナーに申し込むにはものづくりドットコム会員登録が必要です

開催日時


10:30

受講料

55,000円(税込)/人

※本文中に提示された主催者の割引は申込後に適用されます

※銀行振込、会場での支払い

開催場所

全国

主催者

キーワード

化学技術一般   情報技術   CAE/シミュレーション

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受講料

55,000円(税込)/人

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主催者

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化学技術一般   情報技術   CAE/シミュレーション

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